《中国哲学史大纲》的主要内容分为三部分。

第一部分是宇宙论，相当于中国哲学的自然观或天论，其中分述了中国哲学的本根论、大化论，后来补录了形神问题。

在本根论的气论一和气论二两章中，主要阐述了张载、罗钦顺、王廷相、王夫之、颜元、戴震的思想。

此书的第二部分是人生论，指出人生论是中国哲学之中心部分，而且天人合一乃是中国人生思想的一个根本观点。

这一部分的内容丰富，论述也较详，占了全书多一半的篇幅，其中分述了中国哲学的天人关系论、人性论、人生理想论，及人生问题论。

对于人性论之注重，是中国哲学特点之一，而人生论之中心部分是人生理想论，此即关于人生最高准则的理论。

对中国哲学的道德理想主义的阐发主要集中在人生理想论和人生问题论，他晚年注重对中国哲学的价值观的研究亦是以此为基础。

另外，把历史观问题也列入中国哲学的研究范围。

此书的第三部分是致知论，指出知识问题虽然不是中国哲学所注重的，但其论人论天，都在知中；既求闻道，便亦不能不研讨闻道之方。

因此，认为中国哲学完全没有知识论与方法论，其实是谬误的。

致知方法与德行涵养有相依不离的关系，这也是中国哲学的特点之一。

在这一部分中，分述了知论和方法论，包括知之性质与来源、知之可能与限度、真知问题、名与辩问题等等。